中国科学院沈阳应用生态研究所（Shenyang Institute of Applied Ecology, Chinese Academy of Sciences）成立于1954年10月15日，其前身为中国科学院林业土壤研究所，1987年更为现名，2001年被正式批准为中科院国家知识创新工程试点单位，2015年进入中科院“特色研究所”首批试点。 

　　中国科学院沈阳应用生态研究所研究内容主要围绕中国国家农业、林业可持续发展、生态与环境建设中急需解决的重大问题和应用生态学的发展需要，在森林生态与林业生态工程、土壤生态与农业生态工程、污染生态与环境生态工程领域开展基础性、战略性和前瞻性研究，丰富和发展森林生态学、农田生态学和污染生态学的基础理论，为中国主要退化生态系统恢复与重建，改善生态与环境，保障食物安全提供科学依据与关键技术。 

　　截至2015年年末，中国科学院沈阳应用生态研究所共有在职职工392人，其中科技人员和科技支撑人员292人，包括研究员及正高级工程技术人员69人，副研究员及高级工程技术人员95人。有在读研究生340人，其中博士生170人、硕士生170人，有在站博士后25人。